Absolwent ekonomii na UMK w Toruniu oraz studiów podyplomowych z finansów i marketingu na Akademii Ekonomicznej w Poznaniu. W 1983 r. zatrudniony w państwowych wówczas ZNTK Bydgoszcz. Od 1998 r. dyrektor generalny - prezes Zarządu tego przedsiębiorstwa. Po udanym procesie przekształceń własnościowych, restrukturyzacji i zmianie nazwy na PESA Bydgoszcz SA stoi na czele firmy do dziś.

Już w pierwszym dziesięcioleciu XXI wieku – jednocześnie w pierwszej dekadzie PESA jako samodzielnej spółki produkującej własne pojazdy - firma kierowana przez Tomasza Zaboklickiego zdobyła rynki za naszą wschodnią granicą, dostarczyła pociągi do Włoch i wygrała jeden z największych tramwajowych przetargów w Europie – na dostawy 186 Swingów dla Warszawy.

W roku 2012 Tomasz Zaboklicki doprowadził firmę do zawarcia nie tylko największego kontraktu w jej historii, ale także w ostatnich latach w całym polskim przemyśle. Chodzi o umowę ramową z Deutsche Bahn, na mocy której w latach 2015 - 2020 PESA ma dostarczyć narodowemu przewoźnikowi Niemiec 470 spalinowych zespołów trakcyjnych Link łącznej wartości ok. 5 miliardów złotych. Renomowana międzynarodowa firma audytorska Ernst and Young uhonorowała prezesa Zaboklickiego tytułem polskiego Przedsiębiorcy Roku w kategorii „Produkcja” , a redakcja „Wprost” przyznała mu prestiżową Nagrodę Kisiela. W roku 2013 miesięcznik „Forbes” umieścił prezesa Zaboklickiego na 1. miejscu w rankingu „Liderzy polskiego biznesu”.

Rok 2013 zaowocował też kolejnymi wyrazami uznania, z których najbardziej cenne dla prezesa Zaboklickiego i samej firmy PESA jest 2. miejsce w kategorii dużych przedsiębiorstw i 4. miejsce w klasyfikacji generalnej „Rankingu 500 Najbardziej Innowacyjnych Polskich Firm” ogłoszonym przez Instytut Nauk Ekonomicznych PAN.